La décision au cas par cas est prise sur la base des critères posés dans la directive européenne, soit la localisation du projet, ses caractéristiques, ses effets potentiels sur l'environnement. Par conséquent, si le projet de construction présenté lors des différentes demandes d'autorisation a légèrement évolué mais est conforme à celui qui est décrit dans le formulaire de cas par cas (lieu d'implantation, dimension, principales caractéristiques, effets probables) alors il n'y a pas lieu de faire une nouvelle demande.
Il appartient donc au maître d'ouvrage ainsi qu'à l'autorité compétente pour autoriser le projet d'apprécier si la décision déjàémise est suffisante, compte tenu des évolutions du projet et de ses effets probables sur l'environnement et la santé.
Si pour des raisons juridiques, le maître d'ouvrage souhaite disposer d'une décision mentionnant les modifications, une nouvelle demande d'examen au cas par cas devra être déposée. Cette demande sera alors instruite conformément au code de l'environnement (complétude, consultations, délai d'émission de la décision, voies de recours, etc).